Двумя основными особенностями мозга людей с болезнью Альцгеймера являются нейробриллиарные спутанные мозги ("спутанные мозги" для краткости), которые состоят из белка, называемого тау, и старческие бляшки (которые изготавливаются в основном из другого белка, называемого бета-амилоидными, их также иногда называют бета-амилоидными пучками или "пучками" для краткости). Белки тау, которые образуют путаницы, ранее удерживали вместе структуру внутри нейронов, называемую микротрубочкой, которая является важной частью нейрона; она образует часть цитоскелета (скелета клетки), который поддерживает форму клетки, и микротрубочки играют роль в клеточной коммуникации.
Как путаница, так и бляшки могут быть вызваны другими заболеваниями, такими как вирус простого герпеса, тип 1, который исследуется в качестве возможной причины или способствует развитию болезни Альцгеймера. Неизвестно наверняка, являются ли запутывания и бляшки частью того, что вызывает болезнь Альцгеймера, или это результат.
Микротрубочки 
Микротубулы изготовлены из белка, называемого тубулин. Тубулин полимеризуется, т.е. когда молекулы снова и снова образуют одинаковые формы, которые соединяются в группы, и эти группы соединяются между собой. Они могут образовывать длинные цепи или другие формы; в этом случае полимеризованный тубулин образует микротрубочки. Микротрубочки представляют собой жесткие трубки, похожие на микроскопические соломинки, которые полые внутри. Микротрубочки помогают сохранить форму нейрона и участвуют в передаче сигналов через нейрон.
Тау 
Тау - это белок, который содержится в основном в нейронах центральной нервной системы. Они помогают удерживать микротрубочки внутри нейронов. и когда происходят изменения в том, как должны работать белки тау, микротрубочки распадаются. Белки тау, которые больше не удерживают микротрубочки вместе, образуют нити, называемые фибриллами, которые затем собираются внутри нейрона, чтобы создать так называемые нейрофибриллярные спутанные волокна. Эти скопления, также известные как "путаницы тау", - все, что остается после смерти нейрона.
| Тормозная постановка нейрофибриллярных изменений, связанных с болезнью Альцгеймера. В настоящее время она используется только в исследовательских целях |
| Этап | Нейрофибриллярные запутываются: | Симптомы |
| I/IIТранссенторинальная стадия | Транзенторгинальная область и энторгинальная область | Нет симптомов |
| III/IVLimbic стадия | Гиппокампа образования и частей лимбической системы и миндалины | Начало болезни АльцгеймераКогнитивные нарушения: проблемы с памятью, пространственное познание |
| V/VII фокусная фаза | По всей коре головного мозга | Деменция: полностью развитая болезнь Альцгеймера |
Бета-амилоид 
Бета-амилоидные (Aβ) (также называемые "амилоидными бета-бета") бляшки начинаются с белка, называемого белком-предшественником амилоида (APP). APP является одним из белков, которые составляют мембрану или внешнюю оболочку клетки, которая защищает клетку. В этом случае нейрон Так как он сделан внутри клетки, APP высовывается через мембрану клетки.
В различных частях ячейки, в том числе на внешней стороне мембраны, химикаты, называемые ферментами, разбивают АПП на мелкие кусочки. Эти ферменты, которые делают обрезки, являются альфа-, бета- и гамма-секретразы. В зависимости от того, какой фермент производит обрезку и какие части АФП режутся, могут произойти две разные вещи. Одна из них полезна, а другая вызывает образование бета-амилоидных бляшек.
Бляшки образуются, когда бета-секретраза обрывает молекулу APP на одном из концов бета-амилоидного пептида, высвобождая sAPPβ из ячейки. Гамма-секретраза затем разрезает кусочки APP, которые остались и, все еще торчащие из мембраны нейрона, на другом конце бета-амилоидного пептида. После этого срезающий бета-амилоидный пептид высвобождается в пространство за пределами нейрона и начинает прилипать к другим бета-амилоидным пептидам. Эти куски слипаются вместе, образуя олигомеров. Различные олигомеры разных размеров теперь плавают в пространствах между нейронами, которые могут отвечать за реакцию с рецепторами на соседние клетки и синапсы, влияя на их способность функционировать.
Некоторые из этих олигомеров очищены от мозга. Те, которые не очищены, слипаются с большим количеством кусочков бета-амилоида. По мере того, как все больше и больше кусков сгущаются, олигомеры становятся больше, а следующий размер увеличивается, называясь протофибриллами, а следующий размер после этого называется фибриллами. Через некоторое время эти фибриллы собираются вместе с другими белковыми молекулами, нейронами и ненервными клетками, плавающими в пространстве между клетками, и образуют то, что называется бляшками.
церебральная амилоидная ангиопатия (ЦАА)
Отложения бета-амилоида также образуются в стенках (в тунике, средний слой, и тунике адвентиции или тунике экстерна, наружный слой) малых и средних артерий (а иногда и вен) в коре головного мозга и лептоменинги (лептоменги являются двумя внутренними слоями - pia mater и арахноида - менинги, защитная 3-слойная мембрана, покрывающая мозг).
САА встречается у 30% людей старше 60 лет, не страдающих слабоумием, но у 90%-96% людей с болезнью Альцгеймера, и является тяжелым в одной трети - двух третях этих случаев.