Канзасский университет начал программу мужского баскетбола в 1898 году, после прихода Нейсмита. Это было всего через шесть лет после того, как Нейсмит изобрел игру. Нейсмит был принят на работу в качестве директора часовни и инструктора по физкультуре. В эти первые годы большинство баскетбольных матчей проводилось против близлежащих команд YMCA. По всей стране YMCA сыграли очень важную роль в рождении баскетбола. Другими распространенными соперниками были Университет индейских наций Хаскелла и Колледж Уильяма Джуэлла. С Нейсмитом в качестве тренера команда играла только с тремя нынешними "Большими 12 школами": Небраска (шесть раз), Миссури (дважды) и штат Канзас (один раз). Нейсмит, по иронии судьбы, был единственным тренером в истории программы, имевшим рекорд по проигрышам (55-60). Однако Нейсмит тренировал Форреста "Фог" Аллена, который занял пост тренера в Канзасе. Аллен также был добавлен в баскетбольный зал славы. Когда Аллен сам стал тренером и сказал ему, что собирается тренировать баскетбол в Бейкерском университете в 1904 году, Нейсмит сказал ему об этом: "Ты не можешь тренировать баскетбол, ты просто играешь в него". Аллен начал тренерскую карьеру, которая привела его к тому, что он стал известен как "Отец баскетбольного тренера". Во время своего пребывания в Канзасе Аллен тренировал Дина Смита (сборная команды Национального чемпионата 1952 года) и Адольфа Руппа (сборная команды Национального чемпионата Фонда Хелмса 1922 года). Когда Дин Смит ушел на пенсию в качестве главного тренера по баскетболу в Северной Каролине, у него было больше всего побед в истории студенческого баскетбола, вторым был Адольф Рупп (штат Кентукки), а третьим - Аллен. Три тренера присоединились к Нейсмиту в качестве членов Баскетбольного Зала Славы.
К началу века на востоке США было достаточно команд колледжей, чтобы можно было проводить первые игры между различными колледжами. Хотя его спорт постоянно развивался, Нейсмит долгое время рассматривал свою игру как любопытство и предпочитал гимнастику и борьбу как лучшие формы физического воспитания. Однако баскетбол стал демонстрационным видом спорта на Играх 1904 года в Сент-Луисе (США). Как сообщает Зал славы баскетбола, Нейсмит не был заинтересован ни в саморекламе, ни в славе соревновательных видов спорта. Вместо этого он больше интересовался своей карьерой в области физического воспитания, получив почетную степень магистра физкультуры в 1910 году, патрулировал мексиканскую границу в течение четырех месяцев в 1916 году во время Первой мировой войны, ездил во Францию, опубликовал две книги ("Современный колледж" в 1911 году и "Сущность здоровой жизни" в 1918 году) и стал американским гражданином в 1925 году.
В 1935 году Национальная ассоциация тренеров по баскетболу (созданная учеником Нейсмита Фогом Алленом) собрала деньги, чтобы 74-летний Нейсмит смог стать свидетелем включения баскетбола в официальную олимпийскую спортивную программу летних Олимпийских игр 1936 года. Там Нейсмит вручил медали трем командам Северной Америки: команде США - золотую медаль, Канаде - серебряную, Мексике - бронзовую. Во время Олимпиады он был назван Почетным президентом Международной федерации баскетбола. Когда Нейсмит вернулся, он прокомментировал, что видеть игру, в которой играют многие страны, - это самая большая компенсация, которую он мог получить за свое изобретение. В 1937 году Нейсмит сыграл свою роль в создании Национальной ассоциации межуниверситетского баскетбола, которая впоследствии стала Национальной ассоциацией межуниверситетской легкой атлетики (НАИА).
В последующие годы Нейсмит стал почетным профессором в Канзасе и вышел на пенсию в 1937 году в возрасте 76 лет. Включая годы работы тренером, Нейсмит проработал в школе в качестве спортивного директора и преподавателя в общей сложности почти 40 лет. Наисмит умер в 1939 году после того, как у него случилось смертельное кровоизлияние в мозг, и был похоронен в Лоуренсе, штат Канзас. Посмертно его мастерская работа "Баскетбол - его истоки и развитие" была опубликована в 1941 году. В Лоуренсе, Канзас, у Джеймса Нейсмита есть дорога, названная в его честь, Драйв Нейсмита, который проходит перед Алленом Филдхаусом (официальный адрес Аллена Филдхауса - 1700 Драйв Нейсмита), баскетбольной ареной Канзасского университета. Это отдельная четырехполосная дорога, которая проходит на севере и юге от Университетского Драйва до его конца на 24-й улице, чуть южнее кампуса Канзасского университета. Университет также назвал площадку в Аллен Филдхаус, Джеймс Нейсмит Корт в его честь. Нейсмит-Холл, общежитие колледжа, расположено на северо-восточной окраине 19-й улицы и Нейсмит-Драйв.