Генетическая связь возникает, когда аллели в разных локусах не разделяются случайным образом. Таким образом, второй закон Менделя нарушен.
Гены связаны, когда они находятся на одной хромосоме. Затем они склонны оставаться вместе во время мейоза. Аллели для генов на разных хромосомах, как правило, не связаны, из-за независимого ассортимента хромосом во время мейоза.
Существует некоторое скрещивание ДНК во время мейоза, когда хромосомы разделяются. Таким образом, аллели на одной и той же хромосоме могут быть разделены и попасть в разные дочерние клетки. Существует большая вероятность того, что это произойдет, если аллели на хромосоме будут находиться на большом расстоянии друг от друга, так как более вероятно, что между ними произойдет скрещивание. Относительное расстояние между двумя генами можно рассчитать, используя потомство организма с двумя связанными генетическими признаками. Отмечается процент потомства, у которого эти два признака не совпадают. Чем выше процент потомства с обоими признаками, тем ближе к хромосоме оба гена.
Это был первый метод, используемый для картирования генов на хромосомах. Выявляя количество рекомбинантов, можно получить меру расстояния между генами. Это расстояние называется единицей генетической карты (м.е.), или сантиморганом и определяется как расстояние между генами, для которых один продукт мейоза в 100 является рекомбинантным. Рекомбинантная частота (RF) 1% эквивалентна 1 м.е. Карта связи создается путем нахождения на карте расстояний между несколькими признаками, присутствующими на одной хромосоме, в идеале избегая значительных разрывов между признаками, чтобы избежать возможности множественных пересечений.