Водород имеет три основных изотопа: протий (1H), дейтерий (2H) и тритий (3H). Эти изотопы образуются в природе естественным образом. Протий и дейтерий стабильны. Тритий радиоактивен и имеет период полураспада около 12 лет. Ученые создали еще четыре изотопа водорода (4H -7 H), но эти изотопы очень нестабильны и не существуют в природе.

Основные изотопы водорода уникальны, потому что это единственные изотопы, у которых есть название. Эти названия используются и сегодня. Дейтерий и тритий иногда получают собственные символы - D и T. Однако Международному союзу теоретической и прикладной химии не очень нравятся эти названия, хотя они часто используются. Есть и другие изотопы, которые имели собственные названия, когда ученые изучали радиоактивность. Но сегодня их названия уже не используются.