Судно вышло из Ушуайи, Аргентина, 11 ноября 2007 года в 19-дневном круизе, целью которого было проследить маршрут исследователя 20-го века Эрнеста Шеклтона через Дрейк Пассаж (область, типично штормовая с неспокойным морем). После посещения Фолклендских островов и острова Южная Джорджия 23 ноября 2007 года исследователь наткнулся на неопознанный подводный объект в проливе Брэнсфилда недалеко от острова Кинг-Джордж в Антарктическом океане, недалеко от Южных Шетландских островов. Удар, нанесенный Следопытом, вызвал пробоину размером 10 на 4 дюйма (25 × 10 см) со стороны порта судна (слева), которая пропускала морскую воду на борт судна.
Пассажир сообщил о наличии морской воды в салоне примерно в 03:00 по Гринвичу. Хотя некоторые сообщения указывают на то, что не было заметного воздействия или, по крайней мере, не было ничего, кроме обычного хруста льда, наблюдаемого при плавании в ледяных водах, другие сообщения говорят о том, что был громкий взрыв. Некоторые сообщения также указывают на то, что судно дрейфовало в айсберг по правому борту Explorer, в то время как экипаж оценивал ущерб, нанесенный первоначальным ударом по левому борту судна.
В 04:24 по UTC с корабля был сделан вызов на помощь, и спасательные операции были быстро скоординированы военно-морским корпусом Prefectura (Береговой охраной) Аргентинской Республики и Чилийским военно-морским центром поиска и спасения. Чили направило ледокол "Альмиранте Виель" и близлежащие коммерческие суда, включая "МН Ушуайя", "Нэшнл Джеографик Эндевор" и норвежский корабль береговой экспресс "МС Норднорхе", который в то время служил пассажирским круизным лайнером. К 07:30 по UTC все 91 пассажир, 9 гидов и 54 экипажа из более чем 14 стран покинули судно и отправились на спасательные плоты, где они дрейфовали в течение трех-четырех часов, пока не были подобраны норвежским судном MS Nordnorge, которое прибыло на место к 10:00 по UTC. Считается, что Explorer затонул примерно в 19:00 по UTC. По случайности, в начале 2007 года, MS Nordnorge участвовал в другом спасении в Антарктике, когда он эвакуировал 294 пассажира с сестринского судна MS Nordkapp, когда Nordkapp затонул на мели на острове Обмана, части этого же удаленного архипелага Южных Шетландских островов.
Некоторые из спасенных Норднорге были доставлены на чилийскую станцию Эдуардо Фрей Монтальва на острове Короля Джорджа. Позднее они были перевезены на транспортных самолетах С-130 "Геркулес" чилийских ВВС в Пунта-Аренас, Чили, двумя отдельными рейсами в субботу, 24 ноября, и воскресенье, 25 ноября 2007 года. Примерно 70 человек из числа выживших были доставлены на уругвайскую базу "Артигас". Следователь затонул в течение 20 часов после нанесения удара по неизвестному затопленному объекту, который, по сообщениям, был покрыт льдом.