Иоганн Петер Мюллер (14 июля 1801 - 28 апреля 1858), немецкий физиолог, сравнительный анатом, ихтиолог и герпетолог. В 1833 г. стал профессором физиологии в Берлинском университете.
В поздней части своей жизни он в основном посвятил себя сравнительной анатомии. Рыбы и морские беспозвоночные были его любимыми предметами. Он совершил 19 поездок в Балтийское и Северное моря, Адриатику и Средиземное море для изучения жизни в соленой воде.
Он является автором обширной работы по анатомии земноводных, в которую в свою эпоху входили и рептилии. Также он описал несколько новых видов змей.
Мюллер был наставником выдающихся физиологов и биологов, в том числе Германа фон Гельмгольца, Эмиля дю Буа-Раймонда, Теодора Шванна, Фридриха Густава Якоба Хенле, Карла Людвига и Эрнста Хеккеля. В 1834 году он был избран иностранным членом Шведской королевской академии наук. В 1854 г. он был награжден медалью Копли Королевского общества.