30 июня Бессмертная семерка тайно попросила Вильгельма, который находился в Нидерландах вместе с Марией, прибыть в Англию с войском. Вильгельм, который завидовал положению и власти Марии, сначала не хотел ехать. Но Мария сказала Уильяму, что ее не волнует политическая власть. Она сказала, что "будет только его женой и сделает все, что в ее силах, чтобы он стал королем на всю жизнь".
Вильгельм согласился напасть. Он объявил, что новорожденный сын Якова - "притворный принц Уэльский". Он также представил список того, чего хочет английский народ, и сказал, что хочет только, чтобы был собран "свободный и законный парламент". Голландская армия, которая была отброшена назад штормом в октябре, высадилась 5 ноября. Английская армия и флот перешли на сторону Вильгельма. В это время доверие английского народа к Якову было очень низким. Они даже не пытались спасти своего короля. 11 декабря король попытался бежать, но неудачно. Он попытался бежать снова 23 декабря. Эта вторая попытка была успешной, и Яков бежал во Францию. Там он жил в изгнании до самой смерти.
Хотя Мария была опечалена из-за низложения отца, Уильям приказал ей выглядеть счастливой, когда они приехали в Лондон. Из-за этого люди подумали, что она была холодна к отцу. Джеймс также думал, что его дочь была ему неверна. Это глубоко ранило Мэри.
В 1689 году парламент Конвента, созванный принцем Оранским, собрался, чтобы обсудить, что им делать. Вильгельм Оранский чувствовал себя неловко из-за своего положения. Он хотел править как король, а не просто как муж королевы. Единственный пример совместной монархии относится к шестнадцатому веку. Это была королева Мария I и испанский принц Филипп. Когда они поженились, было решено, что принц Филипп примет титул короля. Но Филипп II был королем только при жизни своей жены. Он также не обладал большой властью. Вильгельм хотел остаться королем даже после смерти своей жены. Некоторые важные люди предлагали сделать Марию единственной правительницей. Но Мария, которая была верна своему мужу, отказалась.