Хильдесхайм - один из старейших городов Северной Германии. Возможно, город был основан, когда епископ переехал из Эльзы во Внутренний брод, где находился важный рынок на торговом пути Хеллвег. Вскоре поселение превратилось в город, которому в 983 году король Отто III предоставил рыночные права. Первоначально рынок располагался на улице под названием Старый рынок (Alter Markt), который существует и по сей день. Первое место рынка было выложено вокруг церкви Святого Андрея Первозванного. По мере того, как город становился все больше и больше, рынок становился все более важным. Нынешний рынок в Хильдесхайме был построен в начале 13 века, когда население города составляло около 5000 человек. Когда в 1249 году Хильдесхайм получил городские права, он стал одним из крупнейших городов Северной Германии. В течение четырех столетий священнослужители правили Хильдесхаймом, прежде чем была построена городская ратуша и горожане обрели некоторое влияние и независимость. Строительство нынешней ратуши началось в 1268 году, а в 1367 году Хильдесхайм стал членом Ганзейского союза. Война между гражданами и их епископом стоила дорогих денег в 1519-1523 годах, когда они вступили в междоусобицу. В 1542 году Хильдесхайм стал протестантом, и только кафедральный собор и несколько других зданий остались в руках императора (римского католика). Несколько деревень вокруг города также остались римско-католическими. В 1813 году, после наполеоновских войн, город стал частью Ганноверского королевства, которое после австро-прусской войны 1866 года было аннексировано Прусским королевством в качестве провинции.
Город подвергся бомбардировке во время Второй мировой войны, но бомбардировка не имела большого значения в ходе войны. 28,5% домов были разрушены и 44,7% повреждены. 26,8% домов не получили повреждений. Центр, который до сих пор имел средневековый характер, был почти выровнен. Как и во многих городах, приоритет отдавался скорейшему строительству крайне необходимого жилья, а на месте разрушенных зданий возводились бетонные конструкции. К счастью, большинство крупных церквей, две из которых сейчас являются объектами Всемирного наследия ЮНЕСКО, были восстановлены в оригинальном стиле вскоре после войны. Во время войны ценные материалы Всемирного наследия были спрятаны в подвале городской стены. В 1978 году был основан университет Хильдесхайма. В 1980-х годах началась реконструкция исторического центра. Некоторые из новых бетонных зданий возле рыночной площади были снесены. На их месте были построены копии оригинальных зданий.