Во второй половине дня в день происшествия JA8119 уже выполнил два рейса туда и обратно: JL503/504 в Саппоро и JL363/366 в Фукуока и обратно. В 17:17 самолет только что завершил рейс JL366 и стоял на стоянке у места 18 в Токийском международном аэропорту, готовясь к полету в Осаку, JL123.
В 6.04 вечера самолет начал руление к взлетно-посадочной полосе. Взлет состоялся в 18.12, и самолет поднялся на крейсерскую высоту 24000 футов (около 7300 метров). До этого момента все было в порядке.
В 6.24 вечера внезапно раздался громкий шум, который на самом деле был вызван отказом напорной переборки. Это вызвало взрывную декомпрессию. Воздух хлынул из самолета и оторвал хвост самолета. Поскольку все четыре гидравлические линии, управляющие самолетом, расположены в хвосте, самолет стал неуправляемым. Через 46 секунд пилоты подали сигнал 7700 (означающий, что они находятся в чрезвычайной ситуации) и запросили возвращение в международный аэропорт Токио. Однако, хотя авиадиспетчер разрешил самолету повернуть в сторону Токио, самолет странным образом начал двигаться в северо-западном направлении. В 6.28 вечера токийский авиадиспетчер попросил пилотов повернуть налево, но получил от пилотов сообщение: "Сейчас неконтролируемо". К тому времени самолет двигался способом, называемым фугоидным движением, набирая высоту, пока не терял скорость и не заглох, затем нос опускался и набирал скорость, пока самолет не смог снова набрать высоту. Фугоидное движение повторялось до конца полета.
В 6.31 вечера авиадиспетчер спросил самолет, может ли он приземлиться в аэропорту Нагоя, который находился в 72 милях (около 133 км) от самолета. Однако пилоты хотели вернуться в Токио. Между 18:35 и 18:56 пилоты пытались управлять самолетом без хвоста. Это не удалось, и самолет неконтролируемо полетел в сторону гор.
В 18:56 правое крыло самолета ударилось о хребет. Затем самолет полетел дальше, врезался во второй хребет и взорвался. 520 человек погибли, а 4 выжили.
Время, необходимое для падения самолета после разрушения переборки, составляет 32 минуты. Эта авария стала худшей в истории авиации, связанной с взрывной декомпрессией.