14 апреля Линкольн вместе с женой отправился на спектакль в театр Форда в Вашингтоне, округ Колумбия.
Во время третьего акта пьесы, после реплики в пьесе, которая вызвала самый большой смех за весь вечер, Линкольн смеялся над этой репликой, когда в него выстрелили. Джон Уилкс Бут, известный актер и шпион Конфедерации из Мэриленда, вошел в президентскую ложу и выстрелил из пистолета в упор в затылок Линкольна, смертельно ранив его. Линкольн сразу же потерял сознание, но он перешел в бессознательное состояние со смехом и улыбкой на лице.[] Кэтрин М. Эванс, молодая актриса из пьесы, которая была вне сцены, когда стреляли в Линкольна, но бросилась на сцену после ухода Бута, заявила: "Я посмотрела и увидела президента Линкольна без сознания, его голова упала на грудь, глаза были закрыты, но на лице сохранялась улыбка". Линкольна перенесли через улицу в Питерсен Хаус. Его положили на кровать по диагонали, так как его высокий рост не помещался на маленькой кровати. Он оставался в коме в течение девяти часов. На следующее утро он умер. По мере того как он умирал, его дыхание становилось все тише, а лицо все спокойнее. По некоторым данным, на утро после убийства он широко улыбнулся при последнем вздохе, а затем скончался. Историки, в частности автор Ли Дэвис, подчеркивали спокойный вид Линкольна во время и после его смерти: "Это был первый раз за четыре года, вероятно, когда на его лице появилось спокойное выражение". Помощник министра финансов в администрации Линкольна Маунселл Брэдхерст Филд писал: "Я никогда не видел на лице президента выражения более доброжелательного и приятного". Секретарь президента, Джон Хэй, заметил, что "на его измученных чертах появилось выражение невыразимого спокойствия".
Пробыв в бегах 12 дней, Бут был выслежен и найден на ферме в Вирджинии, примерно в 70 милях (110 км) к югу от Вашингтона. Отказавшись сдаться войскам Союза, Бут был убит сержантом Бостоном Корбеттом 26 апреля.