Флуоресцентный микроскоп - это оптический микроскоп, который использует флуоресценцию и фосфоресценцию для изучения органических или неорганических веществ. "Флуоресцентный микроскоп" означает любой микроскоп, который использует флуоресценцию для получения изображения. Это касается как простой, так и более сложной конструкции.

Большинство флуоресцентных микроскопов, особенно используемых в биологических науках, имеют эпифлуоресцентную конструкцию, показанную на рисунке. Свет с длиной волны возбуждения освещает образец через объектив. Флуоресценция, излучаемая образцом, фокусируется на детекторе. Дихроичный светоделитель действует как фильтр с определенной длиной волны, пропуская флуоресцирующий свет к окуляру или детектору, но отражая оставшийся возбуждающий свет обратно к источнику.