Человеческий микробиом (или человеческая микробиота) - это коллекция микроорганизмов, которые живут на нас. Они живут на коже, в слюне и во рту, в глазах, в кишечнике и остальной части желудочно-кишечного тракта. К ним относятся бактерии, архея, грибы и одноклеточные эукариоты ("простейшие"). Каждый человек носит с собой гораздо больше этих микробов, чем количество человеческих клеток в организме. Человеческое тело насчитывает около 100 триллионов клеток и несет в одном только кишечнике примерно в десять раз больше микроорганизмов.
Микробиом - это "экологическое сообщество соразмерных, симбиотических и патогенных микроорганизмов, которые буквально разделяют пространство нашего тела". Термин был первоначально придуман Иешуа Ледербергом. Он думал, что микроорганизмы, живущие в человеческом теле в здоровье и болезни были важны. Во многих научных статьях проводится различие между "микробиомом" и "микробиотой" для описания либо коллективных геномов микроорганизмов, живущих в нише окружающей среды, либо самих микроорганизмов, соответственно. Однако по первоначальным определениям эти термины в значительной степени являются синонимами.
Некоторые из этих организмов полезны для человека. Однако, большинство из них не имеют известного эффекта. Они просто симбионты: они живут с нами. Те, которые должны присутствовать, являются членами нормальной флоры. В нормальных условиях они не вызывают болезней, но могут даже помочь нашему здоровью. В 2009 году в ходе исследований был задан вопрос, не повредит ли наше здоровье, если мы уменьшим эту биоту. Это, безусловно, относится к кишечной флоре.
Хотя "флора" относится к растениям, а не к бактериям, термин "кишечная флора" широко используется и знаком биологам. Биота" относится к общей коллекции организмов в экосистеме. Термин "микробиота" лучше всего подходит для бактерий и других микроорганизмов, но, несомненно, часто используется термин "флора".
Обсуждаемые микробы, как правило, не являются патогенными (не вызывают болезней, если только они не растут аномально); они существуют в гармонии и симбиозе со своими хозяевами.
Ученые узнали, что большая часть популяции микробов, обнаруженных в человеческом организме, - это не бактерии, а очень старый класс одноклеточных организмов, называемый археями. К ним относятся метаногены, которые вырабатывают метан и могут вызывать метеоризм.
