Сэнгер ушел на пенсию в 1983 году в свой дом "Фар Лейс" в Сваффхэм Булбеке за пределами Кембриджа.
В 1992 году Веллком Траст и Совет по медицинским исследованиям основали Центр Сэнгера (ныне Институт Сэнгера), названный его именем. Институт находится в кампусе геномов Трастового фонда Веллкома недалеко от Хинкстона, всего в нескольких милях от дома Сэнгера. Джон Салстон, директор-основатель, спросил Сэнгера, можно ли назвать этот центр в его честь. Сэнгер согласился, но предупредил: "Лучше бы все было хорошо". Он был открыт самим Сэнгером 4 октября 1993 года, в нем работало менее 50 человек. В настоящее время институт играет ведущую роль в секвенировании генома человека. В настоящее время институт насчитывает более 900 человек и является одним из крупнейших в мире центров геномных исследований.
Хотя он сохраняет свою неприязнь к насилию, он потерял свою квакерскую религиозную веру и называет себя агностиком. В интервью, опубликованном в газете "Таймс" в 2000 году, Сэнгер цитируется как "Сэнгер": "Мой отец был преданным квакером, и меня воспитывали как квакера, и для них правда очень важна". Я отошел от этих убеждений - очевидно, что нужно искать правду, но для этого нужны какие-то доказательства. Даже если бы я хотел верить в Бога, мне было бы очень трудно. Мне нужно было бы увидеть доказательства".
Он отклонил предложение о рыцарстве, так как не хотел, чтобы его называли "Сэр", но позже принял награду орденом"За заслуги".
В 2007 году Британское биохимическое общество получило грант от Wellcome Trust на каталогизацию и консервацию 35 лабораторных тетрадей, в которых Сэнгер записывал свои замечательные исследования с 1944 по 1983 год. Сообщая об этом, научный журнал отметил, что Сэнгер, "самый самоотверженный человек, с которым можно было бы надеяться на встречу", теперь проводит время, занимаясь садоводством в своем доме в Кембриджшире.
Смерть
Сангер умер 19 ноября 2013 года в своем английской семье в Кембридже, в возрасте 95 лет. В настоящее время его научная биография готовится к публикации в 2014 году.
