Carsonella ruddii
Candidatus Carsonella ruddii - эндосимбиотическая гамма-протеобактерия. Она имеет самый маленький геном среди всех известных бактерий.
Этот вид является эндосимбионтом, который присутствует во всех видах насекомых, питающихся соком флоэмы, известных как псиллиды. Эндосимбионт обитает в специализированной структуре, известной как бактериома.
В 2006 году геном одного штамма Ca. C. ruddi был секвенирован в RIKEN в Японии и Университете Аризоны. Геном представляет собой кольцевую хромосому из 159 662 пар оснований и имеет высокую плотность кодирования (97%) с большим количеством перекрывающихся генов и уменьшенной длиной генов. Число предсказанных генов составило 182, что также является самым низким показателем (NCBI-Genome). Многочисленные гены, считающиеся необходимыми для жизни, по-видимому, отсутствуют, что позволяет предположить, что вид, возможно, достиг статуса органеллы.
Для сравнения, геном Mycoplasma genitalium, который имеет самый маленький геном среди всех свободноживущих организмов, состоит из 521 гена.
Вопросы и ответы
В: Что такое Candidatus Carsonella ruddii?
О: Candidatus Carsonella ruddii - это эндосимбиотическая гамма-протеобактерия, которая присутствует во всех видах насекомых, питающихся соком флоэмы, известных как псиллиды.
В: Каков размер генома Candidatus Carsonella ruddii?
О: Геном Candidatus Carsonella ruddii является самым маленьким из известных геномов бактерий и представляет собой круговую хромосому из 159 662 пар оснований.
В: Сколько генов предположительно присутствует в Candidatus Carsonella ruddii?
О: Количество предсказанных генов в Candidatus Carsonella ruddii составляет 182, что является самым низким показателем (NCBI-Genome).
В: Какова плотность кодирования генома Candidatus Carsonella ruddii?
О: Геном Candidatus Carsonella ruddii имеет высокую плотность кодирования - 97%.
В: Что такое бактериома?
О: Бактериома - это специализированная структура, в которой находятся эндосимбионты у Candidatus Carsonella ruddii.
В: Чего не хватает в геноме Candidatus Carsonella ruddii?
О: В геноме Candidatus Carsonella ruddii отсутствуют многочисленные гены, считающиеся необходимыми для жизни, что позволяет предположить, что этот вид, возможно, достиг статуса органеллы.
В: Как геном Candidatus Carsonella ruddii сопоставим с геномом Mycoplasma genitalium?
О: Геном Mycoplasma genitalium, который имеет самый маленький геном среди всех свободноживущих организмов, содержит 521 ген, что значительно превышает количество предсказанных генов у Candidatus Carsonella ruddii.
