В 17 веке дакота жили в Висконсине и Миннесоте. К 1700 году некоторые из них переселились на территорию современной Южной Дакоты. В конце XVII века дакота заключили союз с французскими купцами. Французы пытались использовать этот союз, чтобы помочь им контролировать торговлю пушниной в Северной Америке против англичан.
Дакотская война 1862 года
В конце 1850-х годов нарушения договоров со стороны США и несправедливые выплаты со стороны индейских агентов (правительственных лиц, которым было разрешено взаимодействовать с коренными жителями) привели к усилению голода и лишений среди дакота. Несмотря на то, что дакота пытались договориться с правительством США, ничего не получалось. 16 августа 1862 года группа охотников дакота убила семью поселенцев. Это привело к новым нападениям на поселенцев, и вскоре началась полноценная война. 5 ноября 1862 года 38 воинов дакота были приговорены к смертной казни через повешение. Впоследствии это стало крупнейшей массовой казнью в истории США.
Во время и после восстания многие восточные дакота и их семьи покинули Миннесоту и Восточную Дакоту и ушли в Канаду или поселились в долине реки Джеймс в недолговечной резервации. Затем они были вынуждены переехать в резервацию Кроу Крик на восточном берегу реки Миссури. Некоторые присоединились к западным дакотам и двинулись дальше на запад, чтобы помочь племенам лакота продолжить борьбу против американских военных.
Другие остались в Миннесоте и на востоке, в небольших резервациях, которые существуют до сих пор, включая резервации Сиссетон-Вахпетон, Фландро и Девилс Лейк (Спирит Лейк или Форт Тоттен) в Дакоте. Некоторые переехали в Небраску, где сегодня племя санти-сиу имеет резервацию на южном берегу реки Миссури.
Те, кто бежал в Канаду, оставили для своих семей девять небольших резерваций в Манитобе (Sioux Valley, Long Plain, Dakota Tipi, Birdtail Creek и Oak Lake [Pipestone]) и еще четыре (Standing Buffalo, Moose Woods [White Cap], Round Plain [Wahpeton] и Wood Mountain) в Саскачеване.