История Индонезии, точнее Индонезийского архипелага в Юго-Восточной Азии с 17 508 островами, восходит к Homo erectus (известному под названием "Ява Человек"). Здесь были найдены окаменелые останки около миллиона лет назад.
Австронезийцы, составляющие большинство современного населения, приехали в Юго-Восточную Азию из Тайваня. Они прибыли в Индонезию около 2000 г. до н.э. Коренные меланезийцы отправились в дальневосточные регионы. Сельскохозяйственные условия были очень хорошими. Когда уже в VIII веке до н.э. было развито рисоводство на влажных полях, деревни и города стали развиваться, а к I веку н.э. маленькие царства начали процветать. Положение Индонезии на морском пути способствовало управлению международной торговлей, где торговля как с индийскими царствами, так и с Китаем веками велась уже в течение нескольких веков до нашей эры. Таким образом, торговля с тех пор коренным образом сформировала индонезийскую историю.
Начиная с VII века н.э., мощное военно-морское королевство Шривиджая процветает в результате торговли. Сюда импортировались индуизм и буддизм. В конце XIII века на восточной Яве и при Гаджа Мада было основано индуистское королевство Маджапахит, его влияние простиралось на большую часть Индонезии; этот период в индонезийской истории часто называют "золотым веком".
В XIII веке ислам распространился на северную Суматру. Все больше и больше индонезийских областей постепенно приняли ислам. К концу XVI века это была доминирующая религия на Яве и Суматре. Но она смешивалась с существующими культурными и религиозными влияниями.
Первые европейцы прибыли в Индонезию в 1512 году, когда португальские торговцы во главе с Франсиско Серрао попытались монополизировать источники мускатного ореха, гвоздики и кубического перца в Малуку. Затем последовали голландские и британские торговцы. В 1602 году голландцы основали голландскую Ост-Индскую компанию (VOC) и стали доминирующей европейской державой. Но голландский контроль простирался не очень далеко. Только в начале 20-го века она распространилась на границы сегодняшнего дня.
Во время Второй мировой войны голландцы потеряли контроль и в августе 1945 года Сукарно, влиятельный националистический лидер, провозгласил независимость и был назначен президентом. После некоторых боев Нидерланды официально признали независимость Индонезии в декабре 1949 года (за исключением территории Голландии в Западной Новой Гвинее).
Сукарно перешел от демократии к диктатуре. Но Сукарно уступил власть главнокомандующему вооруженными силами, генералу Сухарто, который был официально назначен президентом в марте 1968 года. Он был поддержан правительством США и поощрял прямые иностранные инвестиции в Индонезию, которые способствовали экономическому росту в течение последующих тридцати лет. Но его правление шло рука об руку с коррупцией и подавлением политической оппозиции.
В 1997 и 1998 годах Индонезия больше всех пострадала от азиатского финансового кризиса. Это усилило недовольство населения Новым порядком и привело к народным протестам. Сухарто ушел в отставку 21 мая 1998 года. В 1999 г. Восточный Тимор проголосовал за выход из государства Индонезия после двадцатипятилетней военной оккупации. После отставки Сухарто демократия улучшилась. Была введена программа региональной автономии, и первые прямые президентские выборы состоялись в 2004 году. Но некоторая политическая и экономическая нестабильность осталась. В 2005 году было достигнуто политическое урегулирование вооруженного сепаратистского конфликта в провинции Ачех.
