Раньше считалось, что ратиты - это одна монофилетическая группа, которая развивалась вместе в Гондване в верхнем меловом периоде. Затем они развивались по отдельности, когда Гондвана распалась, а ее части разошлись в разные стороны. Эти части стали современными южными континентами, а также Африкой и Индийским субконтинентом.
Однако современный генный анализ противоречит этому. Анализ ДНК показывает, что ратиты дивергировали друг от друга слишком недавно, чтобы иметь общего гондванского предка. Однако все анализы показывают, что реас (Южная Америка) и ныне живущие австрало-океанические ратиты монофилетичны.
Недавний анализ двадцати ядерных генов позволяет предположить, что летающие тимамиды относятся к роду ратитов. Тимамиды являются сестринской группой австрало-тихоокеанских ратитов.
Если это так, то "ратиты" в целом будут парафилетическими, а не монофилетическими. Поскольку тимамусы - слабые летуны, это поднимает интересные вопросы об эволюции бесполётности в этой группе. Если тимамусы находятся внутри рода ратитов, то ратиты эволюционировали в бесполётность как минимум три раза. Альтернативным объяснением может быть повторная эволюция полета у тимамусов, но это не имеет прецедента в эволюции птиц, в то время как потеря полета - обычное явление.
