В начале Мухаммад Али вел войну от имени османского султана Махмуда II в Аравии и Греции. Позже он вступил в открытый конфликт с Османской империей.
Его первой военной кампанией была экспедиция на Аравийский полуостров. Святые города Мекка и Медина были захвачены Домом Сауда, в котором существовала форма ислама, называемая ваххабизмом. Вооруженный своим новым религиозным рвением, Мухаммад ибн Сауд начал завоевывать части Аравии.
С главной османской армией, занятой в Европе, Махмуд II обратился к Мухаммеду Али, чтобы вернуть себе арабские территории. Мухаммад Али, в свою очередь, назначил своего сына, Тусун-пашу, возглавить военную экспедицию в 1811 году. Поход был развернут в Аравии, однако в 1812 г. было совершено второе нападение, в результате которого был отвоеван Хеджаз. стр. 43-44 После двухлетнего похода саудовцы были разгромлены, и большая часть саудовской семьи была захвачена в плен. Глава семьи Абдулла ибн Сауд был отправлен в Стамбул и казнен. стр. 48.
Затем Мухаммад Али обратил внимание на военные кампании по своему замыслу, начиная с Судана, который он считал ценным дополнением к территории, золоту и рабам. Судан в то время не имел реальной центральной власти и использовал примитивное оружие в своих племенных боях.
В 1820 году Мухаммад Али направил в Судан армию в составе 5000 военнослужащих под командованием своего третьего сына Исмаила с целью завоевания территории и подчинения ее своей власти. p51 Войска Али продвинулись в Судан в 1821 году, но встретили ожесточенное сопротивление. В конечном итоге завоевание Судана обеспечили египетские войска и огнестрельное оружие. Теперь у Али был форпост, откуда он мог простираться до истоков Нила в Эфиопии и Уганде. Его администрация захватила рабов из Судана, которые затем были превращены в пеший полк солдат. Суровое правление Али в Судане и его ближайших преемников в конечном итоге привело к народной борьбе за независимость самопровозглашенного Махди, Мухаммеда Ахмеда, в 1881 году.
В то время как Мухаммад Али расширял свою власть в Африке, Османская империя столкнулась с этническими восстаниями на своих европейских территориях. Греческое восстание против Османской империи началось в 1821 году. Османская армия не смогла подавить восстание, и этническое насилие распространилось до Константинополя. Султан Махмуд II предложил Мухаммеду Али остров Крит в обмен на его поддержку в подавлении восстания.
Мухаммед Али направил 16 000 солдат, 100 транспортных средств и 63 судна сопровождения под командованием своего сына Ибрагима Паши. стр. 71. Англия, Франция и Россия вмешались, чтобы защитить греков. 20 октября 1827 г. в Наварино весь египетский флот был потоплен европейским флотом союзников под командованием адмирала Эдварда Кодрингтона (1770-1851 гг.). Мухаммад Али пострадал от потери своего компетентного, дорогостоящего флота. С его флотом, уничтоженным, Египет не имел возможности поддерживать свои силы в Греции и был вынужден отступить. В конце концов, кампания стоила Мухаммеду Али его флота ни за что.
Чтобы компенсировать его и Египетские потери, было начато завоевание Сирии. Как и другие правители Египта до него, Али хотел контролировать Леванта, как из-за его стратегической ценности, так и из-за богатых природных ресурсов. Сирия не только обладала богатыми природными ресурсами, но и процветающим международным торговым сообществом с хорошо развитыми рынками по всему Леванту. Это был бы пленный рынок для товаров, которые сейчас производятся в Египте. Возможно, лучше всего то, что Сирия была бы желательна в качестве буферного государства между Египтом и Османским султаном.
Был построен новый флот, поднята новая армия, и 31 октября 1831 года, при Ибрагиме Паше, египетское вторжение в Сирию положило начало Первой турко-египетской войне. Египтяне с легкостью захватили большую часть Сирии. Самое сильное и единственное действительно значительное сопротивление было оказано в портовом городе Акко. В конце концов, египетские силы захватили город после шестимесячной осады. В ходе осады усилились волнения на египетском фронте. Али был вынужден все больше и больше сжимать Египет, чтобы поддержать свою кампанию, и его народ возмущался возросшим бременем.
После падения Акко египетская армия направилась на север в Анатолию. В битве при Конье (21 декабря 1832 г.) Ибрагим Паша одержал убедительную победу над османской армией во главе с великим визирем Решидом Пашой. Теперь между силами Ибрагима и самим Константинополем не было никаких военных препятствий.
В ходе кампании Мухаммед Али внимательно наблюдал за европейскими державами. Опасаясь другого вмешательства, которое обратит вспять все его достижения, он действовал медленно и осторожно. Например, он продолжал практику использования имени султана на пятничных молитвах на вновь захваченных территориях. Он продолжал тиражировать османские монеты, вместо того, чтобы выпускать новые, носящие его подобие. p111 До тех пор, пока марш Мухаммада Али не угрожал полным крахом Османского государства, державы в Европе оставались пассивными наблюдателями.
Несмотря на это шоу, цель Мухаммеда Али заключалась в том, чтобы убрать нынешнего османского султана Махмуда II и заменить его сыном султана, младенцем Абдулмецидом. Эта возможность настолько взволновала Махмуда II, что он принял предложение России об оказании военной помощи. Это привело к договору Хюнкер-Искелеси. p72 Приобретение России вызвало тревогу у британского и французского правительств, поэтому они работали над решением проблемы путем переговоров. В мае 1833 года была подписана Кутахьянская конвенция.
Условия мира заключались в том, что Али выведет свои силы из Анатолии и получит территории Крита и Хиджаза в качестве компенсации. Ибрагим Паша будет назначен Вали из Сирии. Однако мирного соглашения не хватило, чтобы предоставить Мухаммеду Али независимое королевство для себя, оставив его желающим. p122
