HUGO Gene Nomenclature Committee
Комитет по номенклатуре генов HUGO (HGNC) устанавливает уникальное и значимое название для каждого известного гена человека. Он спрашивает мнения экспертов. HGNC дает длинное название и аббревиатуру (называемую символом) каждому гену. HGNC является частью Организации генома человека (HUGO).
Традиционные названия генов и аббревиатуры часто не являются специфичными для одного гена. Пример: CAP (что означает просто "хромосомно-ассоциированный белок") может относиться к любому из шести различных генов: (BRD4, CAP1, LNPEP, PTPLA, SERPINB6 и SORBS1).
В отличие от традиционных названий, таких как CAP, короткие названия генов HGNC, или символы генов, даются только одному гену. Это уменьшает путаницу при определении того, о каком гене идет речь.
Рекомендации по именованию
Подход HGNC к наименованию генов и присвоению символов (сокращений названий генов) таков:
- символы генов должны быть уникальными
- символы должны использовать только римский алфавит и арабские цифры
- символы не должны содержать знаков препинания или "G" для гена
- символы не содержат ссылки на вид, в котором они закодированы, т.е. "H/h" для человека
Полное описание номенклатурных рекомендаций HGNC можно найти на их веб-сайте [2]. HGNC использует приложения _v1, _v2,... для различения различных вариантов сплайсов и _pr1, _pr2,... для вариантов промотора одного гена.
HGNC также утверждает, что "генная номенклатура должна развиваться вместе с новыми технологиями, а не быть ограничивающей, как это иногда происходит, когда применяются исторические системы и системы номенклатуры одного гена".
Процедура
HGNC связывается по электронной почте с авторами, опубликовавшими информацию о рассматриваемом гене человека. У них спрашивают их мнение о предлагаемой номенклатуре. HGNC также сотрудничает с другими кураторами баз данных и экспертами по конкретным семействам генов или наборам генов.
Пересмотр
Изменение стандартизированного названия гена после его утверждения может привести к путанице. Поэтому целесообразность таких изменений является спорной. По этой причине HGNC изменяет название гена только в том случае, если согласие на это изменение может быть получено от большинства исследователей, работающих над этим геном.
Похожие страницы
- Организация генома человека (HUGO)
- Проект "Геном человека
- геном человека
- ген
- номенклатура генов
Вопросы и ответы
В: Какова роль Комитета по номенклатуре генов ХУГО (HGNC)?
О: HGNC устанавливает уникальное и значимое название для каждого известного гена человека.
В: Как HGNC выбирает названия для генов?
О: HGNC спрашивает мнения экспертов, прежде чем дать длинное название и аббревиатуру каждому гену.
В: Что является аббревиатурой для названия, данного каждому гену HGNC?
О: Аббревиатура называется символом.
В: Почему традиционные названия генов и аббревиатуры не являются специфическими для одного гена?
О: Традиционные названия генов и сокращения могут использоваться для обозначения нескольких различных генов, что приводит к путанице.
В: Сколько генных символов дается каждому гену в HGNC?
О: Краткие генные названия HGNC, или генные символы, даются только одному гену.
В: В чем преимущество использования генных символов HGNC вместо традиционных генных имен?
О: Использование генных символов HGNC уменьшает путаницу в вопросе о том, какой ген имеется в виду.
В: Частью какой организации является HGNC?
О: HGNC является частью Организации Генома Человека (HUGO).
