Одноместные
В 1986 году Формула 3000 была представлена в Японии. Компания Mugen совместно с Honda создала двигатель F3000. Он был представлен в сезоне 1987 года и передан в аренду 14 командам. В 1988 году Mugen завоевала четыре из пяти первых мест в японском чемпионате F3000. В 1989 году Mugen вышла в европейский чемпионат F3000 с двигателем MF308. Они выиграли чемпионат с Жаном Алези за рулем Reynard. В том же году компания выпустила свой собственный прототип двигателя 3,5 л V8 для Формулы-1 под кодовым названием MF350.
В 1988 году компания Mugen начала тюнинг двигателей Honda для использования в Формуле-3. Они выиграли японскую серию с Акихико Накайя, а в 1990 году перешли в Европу. Mugen выиграла свой первый чемпионат Формулы-3 в Европе. Они выиграли французский титул с Эриком Элари и британский с Микой Хяккинен. Они также выиграли титул в 1991 году с Рубенсом Баррикелло.
Формула-1
В 1991 году компания Mugen построила двигатели Honda V10 для Tyrrell. В 1992 году двигатель был переименован в Mugen MF351H. Этот двигатель использовался командой Footwork в 1992 и 1993 годах.
В 1994 году Муген перешел в Team Lotus с новым Lotus 109. Команде не хватало средств, а шасси 109 прибыло с опозданием. Автомобиль и его двигатель набрали всего одно очко. В конце года Lotus закрылась.
В 1995 году Mugen перешла в команду Ligier. В 1996 году Mugen выиграла свою первую гонку Формулы-1. Автомобиль с двигателем объемом 3,0 л под кодовым названием MF301H победил на Гран-при Монако 1996 года с Оливье Панисом за рулем.
В 1997 году Ligier перешла в собственность Алена Проста и была переименована в Prost Grand Prix. Когда в 1998 году Прост перешел на двигатели Peugeot, Mugen заключил двухлетнее соглашение с Jordan Grand Prix. В сезоне 1998 года Дэймон Хилл и Ральф Шумахер финишировали в Спа-Франкоршам со счетом 1-2.
В 1999 году Хайнц-Харальд Френтцен дважды победил, а Йорден закончил чемпионат констукторов на третьем месте. В 2000 году Honda Motor Company объявила о своем возвращении в Формулу-1. В 2000 году Honda будет поставлять собственные двигатели для British American Racing. В конце сезона 2000 года компания Mugen ушла из Формулы-1.
Гонки спортивных автомобилей
В 1998 году компания Mugen начала участвовать в гонках спортивных автомобилей. Они построили несколько гоночных автомобилей NSX. В 2000 году команда Mugen/Dome стала чемпионом.
В 2001 году в JGTC Mugen NSX выиграл две гонки. В июне компания объявила о выпуске нового 4,0-литрового V8. Модель MF408S была построена для основного класса прототипов в гонках "24 часа Ле-Мана" и American Le Mans Series.