Полифили - это термин в кладистике. Он описывает группу организмов, последний общий предок которых не является членом группы. Другой способ выражения этого термина заключается в том, что полифилия включает в себя группы, некоторые члены которых происходят от предковых популяций.

На диаграммах видно, что птицы и млекопитающие действительно связаны между собой, но только на уровне ранних амниот. С точки зрения эволюции, между ними существует огромная пропасть.

Более распространенным в традиционной таксономии является включение всех потомков (скажем, живых млекопитающих) без группы, из которой они возникли (которая была бы некоторой кладой в терапсиде). Это делается для удобства, но делает млекопитающих полифилетиками.

Биологическая классификация направлена на группировку видов таким образом, что каждая группа происходит от одного общего предка. Полифилетическая группа может быть "фиксированной" либо путем исключения кладов, либо путем добавления общего предка.

Согласно кладистике, целью классификации должно быть обеспечение монофильности всех групп. Однако другие таксономы утверждают, что существует действительное место для групп, которые являются парафилетическими или содержат своего последнего общего предка, но не всех потомков этого предка.