Фермент рестрикции - это фермент, который разрезает ДНК в определенных местах. Он работает в специфических распознающих нуклеотидных последовательностях, известных как "сайты рестрикции", или рядом с ними. Чтобы разрезать ДНК, все ферменты рестрикции делают два надреза, по одному через каждую нить двойной спирали ДНК.

Эти ферменты содержатся в бактериях и археях и защищают их от вторжения вирусов - бактериофагов.

Внутри прокариот ферменты рестрикции избирательно разрезают чужеродную ДНК в процессе, называемом рестрикцией. ДНК хозяина защищена другим ферментом, который защищает ДНК хозяина и блокирует расщепление. Вместе эти два процесса составляют систему рестрикционной модификации. Это самая ранняя и простая иммунная система. Они также являются своего рода эгоистичными, мобильными генетическими элементами.

Более 3000 ферментов рестрикции были подробно изучены, и более 600 из них доступны на коммерческой основе. Эти ферменты регулярно используются для модификации ДНК в лабораториях и являются важным инструментом в молекулярном клонировании.