Protein Data Bank
Банк белковых данных (PDB) - это коллекция информации о трехмерной (3-D) структуре больших биологических молекул, таких как белки и нуклеиновые кислоты. Биологи и биохимики со всего мира присылают данные. Большинство данных поступает из рентгеновской кристаллографии или ЯМР-спектроскопии. Любой желающий может бесплатно получить доступ к PDB в режиме онлайн. Всемирный банк данных о белках, wwPDB, управляет PDB.
PDB полезна для ученых, изучающих структурную биологию и структурную геномику. Многие ученые вынуждены отправлять свою информацию в базу данных. Основные научные журналы и некоторые финансирующие агентства, такие как Национальные институты здравоохранения США, имеют правила, предписывающие ученым отправлять данные в PDB. В PDB хранятся оригинальные или первичные данные. Сотни других баз данных используют эти данные повторно. Эти вторичные базы данных по-разному организуют информацию. Например, SCOP и CATH объединяют структуры в группы, организованные по типу структуры и представлениям о том, как они связаны между собой в процессе эволюции. Онтология генов объединяет данные в группы, основанные на генах.
Похожие страницы
- База данных молекулярных движений
- Всемирный банк белковых данных (wwPDB) - родительский сайт для региональных хостов (ниже)
- RCSB Protein Data Bank (США)
- PDBe (Европа)
- PDBj (Япония)
- BMRB, Банк данных биологического магнитного резонанса (США)
- Документация wwPDB - документация по форматам файлов PDB и PDBML
- Взгляд на структуры - введение в кристаллографию от RCSB
- Главная страница PDBsum - Извлечение данных из других баз данных о структурах PDB.
- База данных нуклеиновых кислот, NDB - зеркало PDB, специально предназначенное для поиска нуклеиновых кислот
- Вводный учебник по PDB при спонсорской поддержке PDB
Вопросы и ответы
В: Что такое Банк белковых данных (PDB)?
О: Банк данных о белках (PDB) - это коллекция информации о трехмерной (3-D) структуре больших биологических молекул, таких как белки и нуклеиновые кислоты.
В: Откуда берутся данные в PDB?
О: Большинство данных поступает из рентгеновской кристаллографии или ЯМР-спектроскопии.
В: Кто присылает данные для PDB?
О: Данные присылают биологи и биохимики со всего мира.
В: Каждый ли может получить доступ к PDB?
О: Да, любой желающий может бесплатно получить доступ к PDB в режиме онлайн.
В: Кто управляет PDB?
О: Всемирный банк данных о белках (wwPDB) управляет PDB.
В: Почему PDB полезен для ученых?
О: PDB полезен для ученых, изучающих структурную биологию и структурную геномику.
В: Кто отправляет свою информацию в PDB?
О: Многие ученые должны отправлять свою информацию в базу данных. Крупные научные журналы и некоторые финансирующие агентства, такие как Национальные институты здоровья в США, имеют правила, предписывающие ученым отправлять данные в PDB.
