Банк белковых данных (PDB) - это коллекция информации о трехмерной (3-D) структуре больших биологических молекул, таких как белки и нуклеиновые кислоты. Биологи и биохимики со всего мира присылают данные. Большинство данных поступает из рентгеновской кристаллографии или ЯМР-спектроскопии. Любой желающий может бесплатно получить доступ к PDB в режиме онлайн. Всемирный банк данных о белках, wwPDB, управляет PDB.
PDB полезна для ученых, изучающих структурную биологию и структурную геномику. Многие ученые вынуждены отправлять свою информацию в базу данных. Основные научные журналы и некоторые финансирующие агентства, такие как Национальные институты здравоохранения США, имеют правила, предписывающие ученым отправлять данные в PDB. В PDB хранятся оригинальные или первичные данные. Сотни других баз данных используют эти данные повторно. Эти вторичные базы данных по-разному организуют информацию. Например, SCOP и CATH объединяют структуры в группы, организованные по типу структуры и представлениям о том, как они связаны между собой в процессе эволюции. Онтология генов объединяет данные в группы, основанные на генах.