"Оуэн: самый выдающийся зоолог и палеонтолог позвоночных... но самый лживый и одиозный человек". Ричард Брок Фримен (Charles Darwin: a Companion. Dawson 1978)
Оуэн приписал себе и Жоржу Кювье открытие игуанодона, полностью исключив заслугу первооткрывателя динозавра Гидеона Мантелла. Это был не первый и не последний случай, когда Оуэн намеренно выдавал открытие за свое собственное, хотя на самом деле это было не так. В итоге Оуэна исключили из Зоологического совета Королевского общества за плагиат.
Оуэн весьма критически отнесся к книге Дарвина "О происхождении видов", отчасти потому, что Дарвин мало ссылался на предыдущие научные теории эволюции. Вместо этого Дарвин сравнил теорию эволюции путем естественного отбора с ненаучной теорией, изложенной в Библии.
Оуэн, по мнению Дарвина, был "злобным, чрезвычайно злобным, умным; лондонцы говорят, что он сходит с ума от зависти, потому что о моей книге так много говорят". "Больно быть ненавидимым в той сильной степени, в какой Оуэн ненавидит меня".
Оуэн также был участником угрозы прекратить государственное финансирование ботанической коллекции Королевского ботанического сада в Кью (см. Джозеф Далтон Хукер):
"В основе лежало чувство Оуэна, что Кью должен быть подчинен Британскому музею (и Оуэну) и ему нельзя позволить развиваться как независимому научному учреждению с преимуществами большого ботанического сада".
В первой части своей карьеры Оуэн по праву считался одной из великих научных фигур эпохи. Во второй части его карьеры его репутация упала. Это было связано не только с его нечестными отношениями с коллегами, но и с серьезными ошибками в научных суждениях, которые были обнаружены и преданы огласке. Ярким примером тому было его решение отнести человека к отдельному подклассу млекопитающих (см. Томас Генри Хаксли). В этом у Оуэна совсем не было сторонников. Кроме того, его нежелание сойти с забора в отношении эволюции со временем все больше подрывало его репутацию.
Оуэн продолжал работать после своего официального выхода на пенсию в возрасте 79 лет, но он так и не смог вернуть то хорошее мнение, которое получил в молодые годы.