Эволюционная биология развития интерпретирует развитие в свете эволюции и современной генетики. Для краткости ее называют "эво-дево".

В книге "О происхождении видов" (1859) Чарльз Дарвин предложил эволюцию путем естественного отбора - теорию, занимающую центральное место в современной биологии. Дарвин признавал важность эмбрионального развития для понимания эволюции:

"Мы видим, почему признаки, полученные от эмбриона, должны иметь равное значение с признаками, полученными от взрослого человека, поскольку естественная классификация, конечно, включает все возрасты".

Эрнст Геккель (1866) предположил, что "онтогенез повторяет филогенез", то есть развитие эмбриона каждого вида (онтогенез) повторяет эволюционное развитие этого вида (филогенез). Концепция Геккеля объясняла, например, почему у человека, да и у всех позвоночных, на ранних стадиях эмбрионального развития появляются жаберные щели и хвост. С тех пор его теория была в значительной степени дискредитирована.