Термин "национальная церковь" обычно относится к церковной организации в христианстве, которая претендует на пасторскую юрисдикцию над нацией. Этот термин не следует путать с установленной церковью (государственной церковью): национальная церковь отличается от государственной церкви тем, что национальная церковь не обязательно должна быть официально одобрена государством и даже может преследоваться правительством (как православные церкви преследовались при коммунистических режимах).
Термин национальная церковь (или независимая церковь) часто используется в англиканском сообществе и православии, но не является сокращением. Например, Епископальная церковьв Соединенных Штатах Америки считает себя национальной церковью США.
В католицизме термин "национальная церковь" может означать приход, обслуживающий иммигрантов из другой страны.