В начале 1950-х годов он преподавал в Нормальной школе. Затем он начал преподавать психологию в Университете Лилля. В 1954 году Фуко опубликовал свою первую книгу "Злокачественная психика и личность". В середине 1950-х годов он работал в Варшавском университете и в Гамбургском университете.
В 1960 году он вернулся во Францию и стал профессором философии в университете Клермон-Феррана. В середине 1960-х годов Фуко вместе со своей возлюбленной переехал в Тунис (в Северной Африке) и получил работу преподавателя в Тунисском университете. В 1966 году он опубликовал книгу "Порядок вещей" ("Les Mots et les choses"), которая пользовалась большой популярностью. В 1968 году он вернулся во Францию, где опубликовал книгу "L'archéologie du savoir" ("Археология знания").
В конце 1960-х годов, после того как во Франции произошли мощные студенческие протесты и беспорядки, французское правительство создало новый экспериментальный университет в Венсенне. Фуко стал первым главой его философского факультета. Фуко присоединился к студентам, которые занимали административные здания и дрались с полицией.
В 1970 году Фуко стал профессором истории систем мышления в Коллеж де Франс. Теперь его участие в политической жизни усилилось. Его любовник Деферт присоединился к ультрамаоистской Гоше Пролетариен (ГП). Затем Фуко написал книгу "Дисциплина и наказание" ("Surveiller et Punir") о тюрьмах и школах.
