В системах метро других городов "линия" - это то же самое, что и "маршрут" поезда. Однако в системе метро Нью-Йорка "линия" - это собственно пути, по которым ходит поезд "маршрут". "Маршруты", также называемые "услугами", имеют букву или номер, например "1" или "А". "Линии" имеют названия, например, "Бродвейская линия".
Существует 24 железнодорожных маршрута. Сюда входят 3 коротких "челночных" маршрута. Каждый маршрут имеет свой цвет. Р. Роли Д'Адамо, юрист, принявший участие в конкурсе в 1964 году, спланировал цвета, которые сейчас используются на картах метро. Раньше на картах метро использовались разные цвета для каждого маршрута. Люди, живущие в Нью-Йорке, не называют линии и службы по цвету (например, Синяя линия или Зеленая линия). Однако туристы часто используют цвета, чтобы различать маршруты.
Существует три различных типа метро. "Местные" поезда делают все остановки на "местных" станциях, а также на станциях "экспресс". Поезда "экспресс" пропускают некоторые станции, но останавливаются на станциях "экспресс". Существует одна услуга "пропуск остановок" - J/Z, когда два маршрута поездов курсируют по одной линии; каждый маршрут останавливается только на каждой другой станции вдоль линии.
Система метро работает 24 часа в сутки и 7 дней в неделю, но некоторые маршруты не работают, когда в метро ездит мало людей. Когда линия закрыта, управление метрополитена использует бесплатные автобусы-шаттлы. Управление метрополитена сообщает о планируемых изменениях в обслуживании на своем сайте, на стенах станций, в вагонах метро и на своей странице в Twitter.
Магистральные линии
| Первичная магистральная линия | Цвет | Pantone | Сервисные пули |
| Линия Восьмой авеню | Яркий синий цвет | PMS 286 |    |
| Линия IND Шестая авеню | Ярко-оранжевый | PMS 165 |     |
| IND Crosstown Line | Зеленый лайм | PMS 376 |  |
| BMT Canarsie Line | Светло-серый шифер | 50% чёрный |  |
| Линия BMT Нассау Стрит | Терракота коричневая | PMS 154 |   |
| BMT Бродвейская линия | Подсолнечник желтый | PMS 116 |     |
| Линия IRT Бродвей - Седьмая авеню | Томат красный | PMS 185 |    |
| Линия IRT Лексингтон-авеню | Зеленое яблоко | PMS 355 |     |
| Промывочная линия IRT | Малина | Фиолетовый PMS |   |
| Шаттлы | Темно-шиферный серый | 70% чёрный |  |
Маршруты
В метро существует множество маршрутов. Многие люди, которые никогда не ездили в метро, путаются, потому что в нем так много маршрутов, идущих в разные места. В метро есть таблички, которые свисают с потолков станций, чтобы показать маршруты и места, куда они идут.
| Маршруты "A Division", которая раньше была Interborough Rapid Transit Company, следующие: | Маршрут | Имя | |  | Бродвей - Седьмая авеню Местный | |  | Экспресс Бродвей-Седьмая авеню | |  | Экспресс Бродвей-Седьмая авеню | |  | Экспресс на Лексингтон-авеню | |  | Экспресс на Лексингтон-авеню | |   | Лексингтон-авеню Местный | |   | Флашинг Локал/Экспресс | |  | Шаттл по 42-й улице | | Маршруты "B Division", которые раньше принадлежали Бруклин-Манхэттенской транзитной корпорации и Независимой системе метрополитена, следующие: | Маршрут | Имя | Маршрут | Имя | |  | Восьмая авеню экспресс |  | Местные жители Канарси | |  | Экспресс на Шестой авеню |  | Шестая авеню | |  | Восьмая авеню |  | Бродвейский экспресс | |  | Экспресс на Шестой авеню |  | Бродвейский экспресс | |  | Восьмая авеню |  | Местный Бродвей | |  | Шестая авеню |  | Шаттл по Франклин-авеню | |  | Crosstown Local |  | Шаттл Рокавей Парк | |   | Улица Нассау Местный/экспресс |  | Местный Бродвей | |