Начиная с 1791 года, федеральное правительство поддерживалось налогами на дистиллированные напитки, табак, сахар, корпоративные облигации и рабов. Это были косвенные налоги, единственный вид которых разрешался Конституцией Соединенных Штатов. В 1812 году к стоимости войны добавились первые налоги с продаж золота, ювелирных изделий и изделий из серебра. В 1817 году правительство отказалось от всех этих налогов и полагалось на средства от тарифов на импортируемые товары.
Во время Гражданской войны в Америке были необходимы средства для финансирования войны. В 1861 году Конгресс разработал законопроект о прямом налоге на доходы физических и юридических лиц. Этот первый подоходный налог взимал 3% с доходов свыше 800 долларов. Законопроект был принят обеими палатами Конгресса, но так и не вступил в силу. Однако в 1862 году Авраам Линкольн подписал законопроект, который предусматривал 3%-ный налог на доходы в размере от $600 до $5000, 7,5%-ный налог на доходы в размере от $5000 до $10000 и 10%-ный налог на доходы свыше $10000. В Конгрессе велись дебаты по поводу конституционности прямого подоходного налога, но никаких действий предпринято не было. Его действие было разрешено прекратить в 1872 г., когда он подошел к обновлению.
В 1862 году Конгресс уполномочил Комиссара по внутренним доходам. Как и сегодня, он обладал полномочиями по начислению, взиманию и сбору налогов. Он также имел право обеспечивать соблюдение налогового законодательства путем судебного преследования и конфискации имущества и доходов. Джордж С. Бутвелл был первым комиссаром Бюро внутренних доходов. / В 1894 году Конгресс принял Тариф Уилсона-Гормана. Он снизил Тарифы на некоторые виды импорта в Соединенные Штаты. Однако он компенсировал это взиманием 2% прямого подоходного налога. Годом позже Верховный суд в деле Поллок против компании "Фермерские займы и трасты" признал подоходный налог неконституционным. Суд постановил, что Конституция не разрешает взимать подоходный налог без распределения между штатами.
3 февраля 1913 года была ратифицирована шестнадцатая поправка к Конституции Соединенных Штатов. Освободившись от вопроса о критическом распределении, она позволила Конгрессу ввести подоходный налог. Бюро Налогового управления было поручено взимать подоходный налог. Подоходный налог с физических лиц составлял 1% от дохода свыше 3000 долларов США. Доходы свыше 5000 долларов облагались дополнительным 6% налогом. Подоходный налог в 1918 году составлял 77%, чтобы помочь финансировать Первую мировую войну. В 1929 году он упал до максимума в 24%, но во время Великой депрессии в 1929 году снова поднялся. Во время Второй мировой войны были введены удержанные и ежеквартальные налоги.
В 1953 году Бюро внутренних доходов реорганизовано и переименовано в Налоговую службу.
В 1998 году Закон о реструктуризации и реформе IRS снова реорганизовал и модернизировал агентство. Права налогоплательщиков были еще более расширены.
Нынешним комиссаром по внутренним доходам является Чарльз П. Реттиг.