Медицинская микробиология, также известная как ''клиническая микробиология'', - это изучение микробов, таких как бактерии, вирусы, грибки и паразиты, которые вызывают заболевания человека, и их роли в развитии болезни.

Микробы и отрасль микробиологии являются наиболее изученными из-за их огромного значения для медицины.

Медицинская микробиология изучает развитие и прогрессирование инфекционного заболевания у пациента и в человеческой популяции (эпидемиология). Она связана с изучением патологии заболеваний и иммунологии. Она является отраслью медицины и микробиологии и включает в себя пять наук: бактериологию, вирусологию, паразитологию, иммунологию и микологию.