Масс-спектрометр обычно используется одним из двух способов: Полное сканирование или селективный ионный мониторинг (SIM). Типичный ГХ-МС может работать как в одиночку, так и в обоих направлениях одновременно.
Полное сканирование MS
При сборе данных в режиме полного сканирования выбирается и помещается в прибор целевой диапазон фрагментов массы. Примером типичного широкого диапазона фрагментов масс для мониторинга может служить м/з 50 - м/з 400. Определение того, какой диапазон следует использовать, в основном задается тем, что ожидается в образце, но при этом необходимо знать о растворителе и других возможных помехах. Если рассеянный склероз ищет фрагменты массы с очень низким значением m/z, он может обнаружить воздушные или другие возможные интерференционные факторы. Использование большого диапазона сканирования снижает чувствительность прибора. Машина будет выполнять меньше сканирований в секунду, потому что каждое сканирование займет больше времени для обнаружения более широкого диапазона массовых фрагментов.
Полное сканирование полезно при определении неизвестных соединений в образце. Оно дает больше информации, чем SIM, когда речь идет о подтверждении или разрешении соединений в образце. Большинство приборов управляется компьютером, который управляет компьютерной программой, называемой "приборным методом". Приборный метод контролирует температуру в ГХ, скорость сканирования MS и диапазон размеров обнаруживаемых фрагментов. Когда химик разрабатывает инструментальный метод, он посылает тестовые растворы через ГХ-МС в режиме полного сканирования. При этом проверяется время удерживания ГХ и отпечаток пальца фрагмента массы перед переходом к инструментальному методу SIM. Специализированные ГХ-МС приборы, такие как детекторы взрывчатых веществ, имеют приборный метод с предварительной загрузкой на заводе-изготовителе.
Выбранный ионный мониторинг
В выбранном мониторинге ионов (SIM), приборный метод фокусируется на определенных фрагментах ионов. Только эти фрагменты массы обнаруживаются масс-спектрометром. Преимущества СИМ-спектрометра заключаются в том, что предел детектирования ниже, так как при каждом сканировании прибор смотрит только на небольшое количество фрагментов (например, на три фрагмента). Каждую секунду может проводиться больше сканирований. Поскольку отслеживается лишь небольшое количество интересующих фрагментов массы, помехи на матрице, как правило, ниже. Для повышения вероятности правильного считывания положительного результата ионные соотношения различных фрагментов массы сопоставимы с известным эталонным стандартом.
Виды ионизации
После того, как молекулы перемещаются по длине колонки, проходят через линию переноса и попадают в масс-спектрометр, они ионизируются различными способами. Как правило, в любой момент времени используется только один ионизационный метод. Как только образец фрагментирован, он затем детектируется, обычно диодом умножения электронов. Диод обрабатывает ионизированный массовый фрагмент как электрический сигнал, который затем детектируется.
Химики выбирают технику ионизации отдельно от выбора "Полное сканирование" или "Мониторинг SIM-карты".
Электронная ионизация
Наиболее распространенным типом ионизации является электронная ионизация (EI). Молекулы входят в МС (источник - квадруполь или сама ионная ловушка в ионной ловушке МС), где они попадают в свободные электроны, излучаемые из нити накала. Это похоже на нить накала, которую можно найти в стандартной лампе накаливания. Электроны попадают в молекулы, в результате чего молекула фрагментируется характерным для нее способом, который может повторяться. Этот метод "жесткой ионизации" приводит к созданию большего количества фрагментов с низким отношением массы к заряду (м/з). У EI мало фрагментов, если таковые вообще имеются, имеющих массу, близкую к массе исходной молекулы. Химики считают жесткую ионизацию стрельбой электронов в молекулы образца. Напротив, "мягкая ионизация" помещает заряд на молекулу образца, ударяя по ней введенным газом. Структура молекулярной фрагментации зависит от энергии электрона, приложенной к системе, обычно 70 эВ (вольт электрона). Использование 70 эВ помогает сравнивать спектры, генерируемые тестируемым образцом, с известными библиотечными спектрами. (Библиотечные спектры могут быть получены из программного обеспечения, поставляемого производителем, или программного обеспечения, разработанного Национальным институтом стандартов (NIST-USA)). Программное обеспечение производит поиск по библиотечным спектрам с использованием подходящего алгоритма, например, Probability Based Matching (Сопоставление на основе вероятностей) или dot-product (Сопоставление на основе точек-продуктов). В настоящее время многие агентства по стандартизации методов контролируют эти алгоритмы и методы для обеспечения их объективности.
Химическая ионизация
При химической ионизации (ХИ) в масс-спектрометр вводится газ реагента, обычно метан или аммиак. Существует два типа ДИ: положительный ДИ или отрицательный ДИ. В любом случае, газ реагента взаимодействует с электронами и аналитом и вызывает "мягкую" ионизацию интересующей молекулы. Мягкая ионизация фрагментирует молекулу в меньшей степени, чем жесткая ионизация ИИ. Химики предпочитают ИИ, а не ИИ. Это происходит потому, что КИ производит, по крайней мере, один массовый фрагмент с массой, почти равной молекулярной массе интересующего аналита.
Положительная химическая ионизация
При положительной химической ионизации (PCI) газ реагента взаимодействует с молекулой мишени, чаще всего с протонным обменом. В результате этого ионы образуются в относительно больших количествах.
Отрицательная химическая ионизация
При отрицательной химической ионизации (NCI) газ реагента уменьшает влияние свободных электронов на аналит-мишень. Это снижение энергии обычно оставляет фрагмент в большом запасе. (Фрагменты не распадаются дальше).
Интерпретация
Основной целью инструментального анализа является измерение количества вещества. Это делается путем сравнения относительных концентраций среди атомных масс в генерируемом массовом спектре. Возможны два вида анализа - сравнительный и оригинальный. Сравнительный анализ по существу сравнивает данный спектр с библиотекой спектров, чтобы увидеть, присутствуют ли его характеристики для некоторого известного образца в библиотеке. Лучше всего это проводить на компьютере, так как существует много искажений зрения, которые могут иметь место из-за вариаций масштаба. Компьютеры также могут коррелировать большее количество данных (например, время удерживания, определенное ГХ), чтобы более точно соотнести определенные данные.
Другой метод анализа измеряет пики по отношению друг к другу. В этом методе самый высокий пик устанавливается на 100%. Остальным пикам присваивается значение, равное отношению высоты пика к самой высокой высоте. Присваиваются все значения выше 3%. Общая масса неизвестного соединения обычно указывается родительским пиком. Значение этого "родительского" пика может быть использовано для подгонки под химическую формулу, содержащую различные элементы, которые считаются входящими в состав. Структура изотопов в спектре уникальна для элементов, которые имеют много изотопов. Таким образом, он также может быть использован для идентификации различных присутствующих элементов. Это говорит об общей химической формуле неизвестной молекулы. Поскольку структура молекулы и ее связи разрываются характерным образом, их можно идентифицировать по разнице в пиковых массах. Идентифицированная структура молекулы должна соответствовать характеристикам, зарегистрированным в ГХ-МС. Как правило, эта идентификация осуществляется автоматически компьютерными программами, поставляемыми вместе с прибором. Эти программы сопоставляют спектры с библиотекой известных соединений, которые имеют один и тот же список элементов, которые могут присутствовать в образце.
Анализ "полного спектра" рассматривает все "пики" в пределах спектра. Но выборочный ионный мониторинг (SIM) отслеживает только отдельные пики, связанные с определенным веществом. Химики предполагают, что в заданное время удерживания для определенного соединения характерен набор ионов. SIM является быстрым и эффективным анализом. SIM лучше всего работает, когда аналитик имеет предыдущую информацию об образце или ищет только несколько специфических веществ. Когда количество собранной информации об ионах в данном пике газовой хроматографии уменьшается, чувствительность анализа возрастает. Таким образом, SIM-анализ позволяет обнаружить и измерить меньшее количество соединения. Но степень уверенности в идентификации этого соединения снижается.
GC-тандемный МС
При добавлении второй фазы фрагментации масс, например, при использовании второго квадруполя в квадрупольном приборе, она называется тандем MS (MS/MS). МС/МС хорошо измеряют низкие уровни целевых соединений в образце с матрицей фоновых соединений, которые не представляют интереса.
Первый квадруполь (Q1) соединен с ячейкой столкновения (q2) и другим квадруполем (Q3). Оба квадруполя могут использоваться в режиме сканирования или в статическом режиме, в зависимости от типа используемого MS/MS анализа. Типы анализа включают в себя сканирование ионов продуктов, сканирование ионов-прекурсоров, мониторинг селективных реакций (SRM) и сканирование нейтральных потерь. Например: Когда Q1 находится в статическом режиме (смотрят только на одну массу, как в SIM), а Q3 в режиме сканирования, получается так называемый спектр ионов продукта (также называемый "дочерним спектром"). Из этого спектра можно выбрать выдающийся ион продукта, который может быть ионом продукта для выбранного иона-предшественника. Эта пара называется "переход" и образует основу для SRM. SRM является весьма специфическим и почти полностью исключает матричный фон.